Die Datei- und Ordnerberechtigungen im Chat sind so gesetzt, dass das Script auf möglichst allen Servern läuft.
Wenn du der Meinung bist, oder ein Tool dir vorschlägt, Datei- und Ordnerberechtigungen zu ändern, dann spricht grundsätzlich nichts dagegen, das zu tun.
Ich würde aber dringend empfehlen, die jede einzelne Änderung zu notieren, damit du beim Auftreten von Fehlern wieder zum vorherigen Stand zurückkehren kannst. Noch besser: Schritt für Schritt nur immer nur eine Änderung, und dann Testen.
Löschen: Sollte nicht nötig sein. Überflüssige / veraltete Dateien werden automatisch gelöcht.